HERBASE - DOCUMENTACION

Herramientas para nuevos colaboradores

Si desea aportar datos, aquí puede encontrar los modelos de tablas y algunos códigos para ayudar a preparar sus datos en el formato utilizado por HERBASE. Estamos usando el formato datalong, ya que es más eficiente para trabajar. En el formato de datos de HERBASE, cada línea es el recuento (número de individuos) y/o el porcentaje de cobertura de una especie en una parcela. Dado que esto difiere del formato datawide (sitios por especies) comúnmente utilizado, proporcionamos un código para convertir datawide a formato datalong.

• Tabla modelo para datos y metadatos [arquivo model_herb_data_metadata.xlsx]
• Código R para transformar tablas de formato datawide a formato datalong [link para arquivo script_data_transformation.R]

También aconsejamos la verificación taxonómica de su especie de interés antes de enviar los datos, utilizando algunas de las herramientas que se mencionan a continuación. El comité taxonómico de HERBASE también realizará la verificación taxonómica de los datos recibidos.

Flora do Brasil Online 2020: https://floradobrasil.jbrj.gov.br

Pacote FLORA (R): https://cran.r-project.org/web/packages/flora/index.html

Pacote TAXIZE (R): https://cran.r-project.org/web/packages/taxize/index.html

Herramientas para respaldar nuevos inventarios de herbáceas

Si planea iniciar nuevos inventarios de herbáceas, consulte nuestros protocolos sugeridos y algunos materiales para auxiliar en la identificación taxonómica.

Protocolos sugeridos

Ejemplo de un protocolo de muestreo de Helechos utilizado en la red PPBio

https://www.youtube.com/watch?v=RGr-eocYCRU

https://www.youtube.com/watch?v=HpBT2MWj9Us

• Guias de identificación para algunos grupos de herbaceas

Guia de identificación de Zingiberales de la Amazonia Oriental Brasilera https://ppbio.inpa.gov.br/sites/default/files/323%20Zingiberales-e1.pdf

Guia de identificación de Zingiberales de la Amazonia Occidental Brasilera https://ppbio.inpa.gov.br/sites/default/files/Guia_zingiberales_Ebook.pdf

Guia de identificación de leguminosas (herbáceas) de las sabanas de Boa Vista https://ppbio.inpa.gov.br/sites/default/files/LegSavanas-RR_PPBio_09.12.2009.pdf

Guia de identificación de macrófitas de sitios PPBio en Roraima https://ppbio.inpa.gov.br/sites/default/files/785_brazil_macrophytes_of_roraima.pdf

Guia de identificación de Helechos y Licófitos de la reserva de Uatumã https://ppbio.inpa.gov.br/sites/default/files/GuiaSamambaiasUatumaFINAL.pdf

Guia de identificación de marantáceas de las reservas Ducke y Uatumã https://ppbio.inpa.gov.br/sites/default/files/GUIA-marantaceas-ebook_bot.pdf

Guia de campo de herbáceas acuáticas de la várzea Amazónica https://repositorio.inpa.gov.br/handle/1/4741

Field Guides of the Chicago Field Museum https://fieldguides.fieldmuseum.org/